Унутрашња организација

Све послове Архива обавља у више одељења као што су:

• Одељење за заштиту архивске грађе и регистратурског материјала ван Архива
• Одељење за заштиту  архивске грађе у Архиву ( депо)
• Одељење за сређивање и обраду архивске грађе
• Одељење за културно-просветну и информативну делатност
• Одељење општих послова (директор и рачуновођа)

Управни одбор

Миодраг Кутлешић — председник
Братислава Цолић — СО Пирот
Ивана Тасић — од стране колектива
Саша Станковић — СО Бабушница
Саша Иванов — СО Димитровград

Надзорни одбор

Зоран Жикић — председник
Богољуб Манић — град Пирот
Оливера Алексић — од стране колектива
Адријана Спасов — СО Димитровград
Момир Ђокић — СО Бабушница